厚石裙礁大多集中在小琉球東南沿海一帶，沿岸有著壯觀的珊瑚裙礁，於裙礁內有著大片的海蝕平台，因為受到海水的侵蝕作用影響，形成大小不一、凹凸分明的坑洞，早期許多在地人利用坑洞用來曬鹽，由於尚未經過人工開發，現今仍保持完整的原始景觀，整片望去相當壯觀。

建於1929年的白燈塔矗立在小琉球島中心，雖然高度只有10公尺左右，卻與鵝鑾鼻燈塔共同負責台灣海峽與巴士海峽船隻通行的安全，擁有相當重要的地位。

市內有此樹木林立，感受格外暢快。林內規劃獨特適合童年、長者來此運動、散步、看書。真是享受！

美人洞風景區，面對蔚藍的大海，可欣賞美麗的夕陽晚霞、觀海、聽濤

山豬溝步道由珊瑚礁岩組成，是一處靠海的斷崖，同時也擁有島上保存最完整的原始森林。

靈山寺位於小琉球嶼北方沿岸山崖，白沙尾碼頭左側，當東港或中芸前往琉球之交通船駛近該嶼時，首先映入眼簾者，即此古色古香富麗莊嚴之寺觀，該寺係於民國四十九年六月間，由陳乃等士紳募資所興建，並蒙台灣省警備總部琉球職訓三總隊、海軍實踐隊鼎力協助，歷經三年，於五十二年始告完成。

屏東縣「竹林生態濕地公園」為小琉球的第一座生態濕地公園。